目前深圳一共有两家公立医院可以做第三代试管婴儿，分别是深圳市妇幼保健院和北京大学深圳医院，两家医院第三代试管婴儿成功率都很高，但擅长技术会有不同所以排名不分先后。其中深圳市妇幼保健院在获胚胎植入前遗传学检测（PGT）准入资质，连续三年第三代试管婴儿临床妊娠率可达55％以上。而北京大学深圳医院是深圳市较早获得准入第三代试管婴儿资格的，其生殖医学科是深圳市重点医学专科。
1、深圳市妇幼保健院
深圳市妇幼保健院生殖医学中心位于福强院区，成立于1999年，是全市较早成立的同类科室之一，2006年获夫精人工授精(IUI)准入资质，2011年获体外受精-胚胎移植(IVF-ET)准入资质，获胚胎植入前遗传学检测（PGT）准入资质。近年来第三代试管婴儿周期数逐年上升，连续三年临床妊娠率可达55％以上，居国内外先进水平，已诞生数千名婴儿，为不孕不育夫妻圆梦。
2、北京大学深圳医院
北京大学深圳医院生殖医学科成立于2000年，于2002年通过人类辅助生殖技术评审，成为当时广东省三家、深圳市**一家首批获得准入的专科，同年被确定为深圳市重点医学专科。2003年被评为广东省特色专科。该科致力于各种生育功能障碍的临床诊治及相关基础研究，将现代辅助生育技术应用于临床。
这两家医院在深圳当地算是很多错的第三代试管婴儿医院，其不论是在环境、技术、设备、人员等方面都很优秀，但擅长方面会略有不同，大家可以根据自己的实际情况，选择适合自己的医院做第三代试管婴儿。
